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苹果手机短信会自动删除的原因可能有以下几种。
1、自动删除模式设置：苹果手机的短信设置中有一个自动删除模式选项，可能是用户不小心开启了此选项，导致短信在一定时间后自动删除，可以检查并关闭此选项以避免短信被自动删除。
2、系统错误或Bug：有时手机系统出现错误或Bug，可能导致短信自动删除，可以尝试重启手机或更新系统来解决问题。
3、存储空间不足：当手机存储空间不足时，系统会自动清理一些占用空间较大的文件，包括短信，可以通过清理不需要的文件或应用程序来释放存储空间。
4、iMessage信息仅保留登录状态时的会话：如果使用的是iMessage信息，并且开启了“会话仅保留活跃状态时的对话”选项，那么当退出iMessage信息会话或登录状态过期时，会话可能会被自动删除，可以检查并关闭此选项以保留所有会话记录。
原因可能导致短信自动删除的问题，建议逐一排查以找到具体原因并解决，如果问题仍然存在，建议咨询苹果官方客服寻求进一步的帮助。